Besaran hadiah untuk juara Piala Presiden terus mengalami kenaikan dari satu penyelenggaraan ke penyelenggaraan berikutnya. Dalam kurun 10 tahun terakhir, total kenaikannya tercatat sekitar 170 persen.
Pada awal penyelenggaraan, hadiah juara Piala Presiden berada di angka Rp3 miliar. Kini, nominal tersebut telah meningkat menjadi Rp8 miliar.